MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022784	GCCT	2	8	83610	83617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_022784	TCA	2	6	83784	83789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_022784	CGT	2	6	83864	83869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_022784	GTT	2	6	83967	83972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_022784	C	6	6	84040	84045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1506	NC_022784	AGATT	2	10	84049	84058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_022784	GA	3	6	84075	84080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_022784	GT	3	6	84101	84106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_022784	TTG	2	6	84162	84167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_022784	TGCT	2	8	84191	84198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_022784	TGG	2	6	84242	84247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_022784	GA	3	6	84334	84339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_022784	GC	3	6	84372	84377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_022784	TTA	2	6	84386	84391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_022784	GTTT	2	8	84392	84399	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_022784	T	6	6	84397	84402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_022784	GGTG	2	8	84428	84435	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_022784	GT	3	6	84448	84453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_022784	TTG	2	6	84527	84532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_022784	CTG	2	6	84571	84576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_022784	GGC	2	6	84599	84604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_022784	GAAG	2	8	84621	84628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_022784	GAT	2	6	84710	84715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_022784	CGG	3	9	84809	84817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625361
1525	NC_022784	GTTT	2	8	84837	84844	0 %	75 %	25 %	0 %	557625361
1526	NC_022784	GAT	2	6	84883	84888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625361
1527	NC_022784	CCT	2	6	84895	84900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625361
1528	NC_022784	GCT	2	6	85002	85007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1529	NC_022784	ACA	2	6	85024	85029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625361
1530	NC_022784	ATC	2	6	85120	85125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625361
1531	NC_022784	TCCG	2	8	85182	85189	0 %	25 %	25 %	50 %	557625361
1532	NC_022784	T	6	6	85231	85236	0 %	100 %	0 %	0 %	557625361
1533	NC_022784	CTG	2	6	85352	85357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1534	NC_022784	GC	3	6	85498	85503	0 %	0 %	50 %	50 %	557625361
1535	NC_022784	T	6	6	85557	85562	0 %	100 %	0 %	0 %	557625361
1536	NC_022784	TTA	2	6	85613	85618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625361
1537	NC_022784	GCA	2	6	85626	85631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1538	NC_022784	CT	3	6	85657	85662	0 %	50 %	0 %	50 %	557625361
1539	NC_022784	TTTGTG	2	12	85665	85676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625361
1540	NC_022784	CTCA	2	8	85710	85717	25 %	25 %	0 %	50 %	557625361
1541	NC_022784	CAA	2	6	85772	85777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625361
1542	NC_022784	CTG	2	6	85818	85823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1543	NC_022784	G	6	6	85823	85828	0 %	0 %	100 %	0 %	557625361
1544	NC_022784	T	6	6	85938	85943	0 %	100 %	0 %	0 %	557625361
1545	NC_022784	CTG	2	6	86144	86149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1546	NC_022784	CAT	2	6	86162	86167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625361
1547	NC_022784	TCG	2	6	86208	86213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1548	NC_022784	GC	3	6	86232	86237	0 %	0 %	50 %	50 %	557625361
1549	NC_022784	TCGC	2	8	86251	86258	0 %	25 %	25 %	50 %	557625361
1550	NC_022784	TC	3	6	86289	86294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_022784	TGT	3	9	86336	86344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625362
1552	NC_022784	CTC	2	6	86610	86615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625362
1553	NC_022784	TG	3	6	86780	86785	0 %	50 %	50 %	0 %	557625362
1554	NC_022784	GCA	2	6	86894	86899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625362
1555	NC_022784	GCCG	2	8	87015	87022	0 %	0 %	50 %	50 %	557625362
1556	NC_022784	AGC	2	6	87110	87115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625362
1557	NC_022784	TGC	2	6	87130	87135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625362
1558	NC_022784	GCT	2	6	87238	87243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625363
1559	NC_022784	CTT	2	6	87293	87298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625363
1560	NC_022784	CCT	2	6	87311	87316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625363
1561	NC_022784	CG	3	6	87496	87501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_022784	AAT	2	6	87609	87614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_022784	TGT	2	6	87650	87655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_022784	TTG	2	6	87685	87690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1565	NC_022784	AG	3	6	87699	87704	50 %	0 %	50 %	0 %	557625364
1566	NC_022784	GCA	2	6	87723	87728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1567	NC_022784	CGT	2	6	87729	87734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1568	NC_022784	GT	3	6	87733	87738	0 %	50 %	50 %	0 %	557625364
1569	NC_022784	GAG	2	6	87798	87803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625364
1570	NC_022784	TGA	2	6	87838	87843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625364
1571	NC_022784	GAA	2	6	87873	87878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625364
1572	NC_022784	GGTG	2	8	87929	87936	0 %	25 %	75 %	0 %	557625364
1573	NC_022784	GTT	2	6	87989	87994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1574	NC_022784	CTT	2	6	88024	88029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625364
1575	NC_022784	TGT	2	6	88035	88040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1576	NC_022784	GGC	2	6	88049	88054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625364
1577	NC_022784	TGAG	2	8	88072	88079	25 %	25 %	50 %	0 %	557625364
1578	NC_022784	AGC	2	6	88091	88096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1579	NC_022784	GC	4	8	88095	88102	0 %	0 %	50 %	50 %	557625364
1580	NC_022784	GCA	2	6	88181	88186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1581	NC_022784	AAG	2	6	88218	88223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625364
1582	NC_022784	TAA	2	6	88225	88230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625364
1583	NC_022784	CTT	2	6	88258	88263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625364
1584	NC_022784	GGCT	2	8	88270	88277	0 %	25 %	50 %	25 %	557625364
1585	NC_022784	CCG	2	6	88320	88325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625364
1586	NC_022784	GTT	2	6	88404	88409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1587	NC_022784	GGAG	2	8	88423	88430	25 %	0 %	75 %	0 %	557625364
1588	NC_022784	TGGGTG	2	12	88448	88459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625364
1589	NC_022784	TTG	2	6	88495	88500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1590	NC_022784	GCT	2	6	88502	88507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1591	NC_022784	CG	3	6	88563	88568	0 %	0 %	50 %	50 %	557625364
1592	NC_022784	GTA	2	6	88619	88624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625364
1593	NC_022784	GATG	2	8	88648	88655	25 %	25 %	50 %	0 %	557625364
1594	NC_022784	TCC	2	6	88676	88681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625364
1595	NC_022784	GTG	2	6	88720	88725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625365
1596	NC_022784	CT	3	6	88980	88985	0 %	50 %	0 %	50 %	557625365
1597	NC_022784	TGT	2	6	88995	89000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625365
1598	NC_022784	GGA	2	6	89178	89183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625365
1599	NC_022784	TTG	2	6	89207	89212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625365
1600	NC_022784	T	7	7	89309	89315	0 %	100 %	0 %	0 %	557625365
1601	NC_022784	TG	3	6	89355	89360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_022784	CA	3	6	89534	89539	50 %	0 %	0 %	50 %	557625366
1603	NC_022784	AAG	2	6	89575	89580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625366
1604	NC_022784	TGT	2	6	89627	89632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625366
1605	NC_022784	T	6	6	89779	89784	0 %	100 %	0 %	0 %	557625366
1606	NC_022784	TGG	2	6	89796	89801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625366
1607	NC_022784	TGT	2	6	89810	89815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625366
1608	NC_022784	AG	3	6	89823	89828	50 %	0 %	50 %	0 %	557625366
1609	NC_022784	GTGG	2	8	89863	89870	0 %	25 %	75 %	0 %	557625366
1610	NC_022784	GT	3	6	89936	89941	0 %	50 %	50 %	0 %	557625366
1611	NC_022784	CAA	2	6	89967	89972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625366
1612	NC_022784	GT	3	6	90064	90069	0 %	50 %	50 %	0 %	557625366
1613	NC_022784	CTG	2	6	90101	90106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1614	NC_022784	TGC	2	6	90121	90126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1615	NC_022784	GCT	2	6	90132	90137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1616	NC_022784	CT	3	6	90147	90152	0 %	50 %	0 %	50 %	557625366
1617	NC_022784	ATA	2	6	90181	90186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625366
1618	NC_022784	TGC	2	6	90190	90195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1619	NC_022784	GTG	2	6	90310	90315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625366
1620	NC_022784	T	6	6	90388	90393	0 %	100 %	0 %	0 %	557625366
1621	NC_022784	CTT	2	6	90399	90404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625366
1622	NC_022784	GT	3	6	90583	90588	0 %	50 %	50 %	0 %	557625366
1623	NC_022784	TGG	2	6	90606	90611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625366
1624	NC_022784	GCCT	2	8	90649	90656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_022784	N	61	61	90657	90717	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022784	TAG	2	6	90750	90755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022784	ACC	2	6	90765	90770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_022784	GGT	2	6	90781	90786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_022784	TCT	2	6	90812	90817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625367
1630	NC_022784	TGC	2	6	90837	90842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625367
1631	NC_022784	C	6	6	90856	90861	0 %	0 %	0 %	100 %	557625367
1632	NC_022784	GGC	2	6	90910	90915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625367
1633	NC_022784	TC	3	6	91011	91016	0 %	50 %	0 %	50 %	557625367
1634	NC_022784	ACGA	2	8	91019	91026	50 %	0 %	25 %	25 %	557625367
1635	NC_022784	CATG	2	8	91029	91036	25 %	25 %	25 %	25 %	557625367
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1639	NC_022784	GCC	3	9	91106	91114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625367
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1645	NC_022784	TA	3	6	91376	91381	50 %	50 %	0 %	0 %	557625367
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1658	NC_022784	CGG	2	6	92169	92174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1659	NC_022784	GAAT	2	8	92320	92327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1660	NC_022784	TA	4	8	92349	92356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1661	NC_022784	CTG	2	6	92391	92396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1663	NC_022784	ACA	2	6	92421	92426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1664	NC_022784	T	6	6	92432	92437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1665	NC_022784	CCAC	2	8	92481	92488	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1666	NC_022784	GAA	2	6	92540	92545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1667	NC_022784	AAG	2	6	92549	92554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1673	NC_022784	CTA	2	6	97514	97519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1674	NC_022784	TCA	2	6	97527	97532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1675	NC_022784	TGT	2	6	97540	97545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1676	NC_022784	T	6	6	97545	97550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1704	NC_022784	TGC	2	6	99487	99492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1750	NC_022784	GT	4	8	101801	101808	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1751	NC_022784	N	90	90	101832	101921	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1755	NC_022784	AGC	2	6	102098	102103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1757	NC_022784	TAT	2	6	102214	102219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1758	NC_022784	TGC	2	6	102241	102246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1759	NC_022784	ACGTG	2	10	102267	102276	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1760	NC_022784	GGT	2	6	102362	102367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1761	NC_022784	GC	3	6	102369	102374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1762	NC_022784	TCC	2	6	102413	102418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1764	NC_022784	T	7	7	102438	102444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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